› georgy klochkov · computergestützte rna-biologie · ulm, deutschland
Zwanzig Jahre Integrations- und Infrastruktur-Engineering in Banken und Industrie, jetzt angewandt auf computergestützte RNA-Biologie. Mein Schwerpunkt: Ergebnisse des maschinellen Lernens zur RNA-Struktur so aufzubereiten, dass andere sie überprüfen können.
Modelle für RNA-Sekundärstrukturen werden meist auf zufälligen Splits evaluiert. Dieses Projekt untersucht, wie viel ihrer Genauigkeit bleibt, wenn Trainings- und Testdaten nach RNA-Familien getrennt werden, und stellt eine minimale Pipeline bereit, mit der jeder das Ergebnis selbst nachrechnen kann.
cobalt ist ein kleines Werkzeug für die Verarbeitung und Qualitätskontrolle von Sequenzen. Es liest Eingabesequenzen ein, prüft sie und gibt saubere, konsistente Datensätze weiter. Im obigen Projekt bildet es die Eingabeschicht der Pipeline.
Ich habe Computertechnik an der Staatlichen Technischen Universität
Moskau N. E. Bauman studiert. Seitdem habe ich in Banken, Industrie
und Beratung an Unternehmensintegration, Datenflüssen und
Softwarearchitektur gearbeitet, auch als Teamleiter und Architekt.
Jetzt bringe ich diese Erfahrung in die computergestützte Biologie
ein, wo Reproduzierbarkeit ebenso eine offene Frage ist wie die
Anwendung neuer Ansätze. Ich lebe in Ulm und bin offen für hybrides
Arbeiten oder Remote-Arbeit.
Gerne auch auf Englisch.
Zuvor: Software- und Integrations-Engineering in Banken, Automobilbranche und eingebetteten Systemen, 2007–2026.
Ich suche Forschungsstellen in der computergestützten RNA-Biologie. Raum Ulm oder Tübingen, offen für hybrides Arbeiten oder Remote-Arbeit.